En el caso de los comicios de Gobernador, cuyos resultados favorecieron al priísta Manuel Andrade, los resultados fueron apelados por los partidos Acción Nacional (PAN), de la Revolución Democrática (PRD) y Verde Ecologista de México (PVEM), así como el propio Revolucionario Institucional (PRI). El recurso interpuesto por el PRI fue con la intención de dar mayor certeza al triunfo de Andrade..

La instancia electoral resolvió anular un total de 27 casillas, de las cuales 17 fueron reclamadas por el PAN y 10 por el PRD, por dolo o error aritmético en los cómputos y porque fueron conformadas por funcionarios que no fueron notificados de manera oportuna.

La Magistrada María Cristina Amézquita descartó que las impugnaciones a la elección de Gobernador pudieran afectar el aval que emitió el Consejo Electoral al priísta Manuel Andrade.

En cuanto a inconformidades a comicios de Presidentes municipales, la más sobresaliente fue la del PRD al triunfo del priísta Andrés Graniel, en la Alcaldía de Centro.

El PRD pidió la anulación de 384 casillas, de las cuales al final los Magistrados acordaron cancelar los resultados de dos, al comprobar que existió dolo o errores aritméticos en sus cómputos. Otras siete casillas fueron anuladas porque los funcionarios del día de la jornada electoral no eran los asignados.

La Sesión del Tribunal Electoral de Tabasco terminó a las 11:15 horas y 30 minutos antes uno de los representantes del PRD ante ese órgano, Enrique Morales Cabrera, gritó a los magistrados: "¡Están regalando votos, no están debatiendo... ¡ ¡Debatan!".

Momentos después otro perredista distribuyó fotocopias con consignas a los magistrados y ello obligó al Presidente del Tribunal, Eduardo Méndez, a expulsar a la mayoría del público, permitiendo sólo la presencia de prensa y representantes del PRI.