| 2002 | |
| 4 de febrero | Fox concluyó una rápida visita a la isla, que tenía el objetivo de relanzar las relaciones bilaterales, con una reunión con un grupo de disidentes cubanos |
| 27 de febrero | Unas declaraciones del ministro de Exteriores, Jorge G. Castañeda en Miami, supuestamente manipuladas por Radio Martí, terminaron con la invasión por parte de una veintena de cubanos de la embajada de México en la Habana en busca de asilo. |
| 1 de marzo | Fuerzas especiales cubanas desalojaron la sede diplomática supuestamente a petición del Gobierno de México |
| 21 de marzo | Tras un breve discurso en la tribuna de la Conferencia sobre Financiación al Desarrollo de Monterrey, Castro anunció que debía abandonar la reunión por "una situación especial originada por su presencia" en este foro |
| Ese mismo día, Castañeda rechazó cualquier relación de Estados Unidos con la retirada de Castro. |
| 22 de marzo | El presidente de la Asamblea Popular cubana, Ricardo Alarcón, denunció que el Gobierno de México pidió a Castro que se retirara para evitar un encuentro con el presidente de EEUU, George Bush |
| Horas después, Fox negó a la prensa la versión cubana. |
| 26 de marzo | El diario "Granma", órgano oficial del Partido Comunista cubano, acusó a Castañeda de ser el "arquitecto" del conflicto y seguir instrucciones de Estados Unidos |
| México rehúsa dar una respuesta oficial a las acusaciones a menos que se presentaran por los cauces oficiales. |
| 15 de abril | El Gobierno mexicano anuncia que, por primera vez en la historia, votará a favor de la resolución presentada por Uruguay en la ONU en la que se denuncia la situación de los derechos humanos en Cuba y recomienda el envío de un relator de la Alta Comisaría de Naciones Unidas para los Derechos Humanos a la isla. |
| 25 de abril | Fox se disculpó con los mexicanos que pudieron sentirse "engañados" por su actitud en el conflicto con Cuba, mientras su canciller, Jorge Castañeda, reconoció, finalmente, que Estados Unidos pidió evitar encuentros entre Bush y Castro en Monterrey. |
| 15 de mayo | El presidente mexicano aseguró que los "eventos" entre su país y Cuba "quedaron definitivamente aclarados" y la relación bilateral "continúa en los mismos términos" que antes de que se produjeran. |
| 10 de septiembre | La Cancillería mexicana presentó una denuncia oficial ante la Contraloría en contra de su embajador en Cuba, Ricardo Pascoe, por malversación de fondos e irregularidades en diversas contrataciones de funcionarios |
| 1 de octubre | La diplomática mexicana Roberta Lajous Vargas fue designada por Fox como nueva embajadora de México en Cuba. |
| 2003 | |
| 14 de abril | El Gobierno mexicano lamentó la ejecución de tres cubanos condenados a muerte por el secuestro de una lancha con medio centenar de pasajeros, y reiteró su posición de respeto a los derechos fundamentales |
| 17 de abril | La Comisión de Derechos Humanos de Naciones Unidas aprobó en Ginebra una resolución presentada por Uruguay, Perú y Nicaragua que insta a Cuba a colaborar con la Alta Comisaría para los Derechos Humanos, un documento considerado por el Gobierno de la isla como "aguado y cínico". |
| 11 de julio | La VI Reunión Interparlamentaria México-Cuba concluyó con discrepancias sobre la inclusión o no de la situación de los disidentes de la isla en la declaración final. |
| 29 de septiembre | El Gobierno de México anunció que pretende impulsar una "nueva agenda de trabajo" con Cuba tras los incidentes del año pasado que tensaron la relación bilateral. |
| 14 de octubre | Cuba instó a las autoridades mexicanas a consolidar los vínculos bilaterales entre los dos países y a actuar con una misma voz en los organismos multilaterales. |
| 2004 | |
| 30 de marzo | El empresario mexicano de origen argentino Carlos Ahumada, conocido en México como "El señor de los sobornos", fue detenido en Cuba, lo que dio inicio a su proceso de extradición a este país. |
| 28 de abril | Cuba deportó a Ahumada de forma inesperada a México, en lugar de consumar el proceso de extradición, cuyos trámites provisionales ya habían comenzado. |
| 29 de abril | La interpretación hecha en Cuba de que el caso Ahumada tenía una "connotación política" fue considerada por la Cancillería mexicana como inadmisible y contestada con una nota diplomática. |
| 1 de mayo | Castro dice que lamenta que el prestigio en política exterior ganado en América Latina y en el mundo durante décadas "haya sido convertido en cenizas". |
| 2 de mayo | México decide expulsar al representante diplomático de Cuba y retirar a su embajadora en La Habana, lo que pone las relaciones diplomáticas al borde de la ruptura. |